Efterskoleforeningen har 3 enheder.
Hver enhed ledes af en formand valgt blandt styrelsens medlemmer. Endvidere indgår yderligere to styrelsesmedlem i hver enhed.
Hver enhed har tilknyttet en konsulent fra Efterskoleforeningen.
Til enhederne er knyttet en række faste udvalg og ad-hoc grupper, hvor eksterne medlemmer af foreningen kan arbejde med målrettede opgaver.
Se oversigt over udvalg og repræsentation 2009 pdf